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大约 25,000 种陆生和水生植物生活在地中海及其周围。其中，有一半在地球上其他任何地方都找不到。 IUCN 红色名录对地中海的 473 种水生植物进行了研究。该组织确定，其中至少有 15% 有灭绝的危险。除了受威胁的本土植物，地中海还引入了水生植物群。污染、海洋生物群落的退化和入侵物种都在影响地中海水生植物方面发挥了作用。

水仙草

水仙草，也称为沼泽仙草（Hydrocotyle vulgaris），是一种发现于地中海的水生植物。虽然原产于北非和欧洲地区，但它不是地中海地区的地方病，也不是仅在地中海地区发现的。 5 英寸宽的叶子，形状像圆形盾牌，漂浮在水面之上。水仙草开花，开出不显眼的白花。它们在地中海生物群落中没有危险。

白莲花

白莲花，也被称为埃及白睡莲（睡莲），发现于地中海地区的死水中。它原产于尼罗河，已被引入地中海生物群落。花茎从漂浮的睡莲叶中分枝，高度可达 20 英寸。花是白色的，多瓣的和星形的。白莲花在地中海濒临灭绝。

水葫芦

水葫芦 (Eichornia crassipes) 是地中海盆地的入侵物种，原产于南美洲。根据世界自然保护联盟红色名录，地中海地区的水葫芦数量每两周翻一番。这种植物的坚韧长叶漂浮在水面上，阻止阳光穿透，从而影响下面的生态系统。水葫芦还胜过本地水生植物并干扰船只交通。该物种产生艳丽的蓝紫色花朵。六瓣花在茎的顶部形成一个细长的团块或管状。

海王星草

海王星草 (Posidonia oceanica) 目前仅在地中海和澳大利亚南部水域发现。它可能被发现在 15 到 165 英尺的深度。它的带状草叶沿着水平的根茎慢慢生长，形成水下草甸。不幸的是，它被引进的水生绿藻 Caulerpa taxifolia 严重击败。 Caulerpa taxifolia 从加勒比地区引进，并迅速在地中海地区大量繁殖。它的羽毛状绿色叶片形成侵入性团块。据水生和入侵植物中心称，在它自己建立的地区，它每年能够杀死 45% 的海王星草种群。